一年一度的国自然基金资助项目于上周放榜,各大平台陆续开始解析国自然项目内容,m6a rna甲基化作为近三年来最火热的研究方向之一,国自然今年立项数目更是呈爆发式增长,天昊生物市场部从多个关键词入手,发现2019年m6a rna甲基化项目共计179项,比2018年增长了一倍之多。
从项目类型划分,重点项目3项,面上项目89项,青年基金81项,地区基金6项。
其中部分老师在相应的领域已经有m6a相关的重要成果发表:
从科研单位划分,共计76个单位拿到了资助项目,中山大学在m6a领域仍然独占鳌头,拿到了20项,南京医科大学以17项占据次席,上海交通大学9项,华中科技大学7项,浙江大学6项,武汉大学6项,中南大学6项,哈尔滨医科大学5项,同济大学5项,郑州大学5项。
中山大学在国内一直是m6a修饰表观领域的领跑者,作为第一单位或合作单位,2019年以来就有近26篇文章发表,其中包括1篇nature (histone h3 trimethylation at lysine 36 guides m6a rna modification co-transcriptionally),1篇cell research (transcriptome-wide reprogramming of n6-methyladenosine modification by the mouse microbiome),1篇science advances (single-base mapping of m6a by an antibody-independent method),2篇nature communications和3篇molecular cancer。
从研究方向划分,绝大多数项目都是与医学(健康或疾病)相关,农口相关的项目仅10项。医学疾病领域,肿瘤仍然是最主要的方向,约77项,最常见的包括肺癌、肝癌、胃癌、乳腺癌和结直肠癌等。研究的主要内容包括m6a修饰如何影响肿瘤的发生、增殖、转移、耐药等。
其它主要的疾病方向包括心血管疾病(动脉粥样硬化、心肌梗死、心肌肥大、心肌炎症等共15项,部分如下图)、神经脊髓相关(11项)、骨相关(9项)、糖尿病(7项)、胚胎发育分化(7项)、孕期疾病(4项)、肺部疾病(3项)、脂肪代谢(3项)、肾脏疾病(3项)、脓毒症(2项)、银屑病(2项)等。
从研究思路上看,今年m6a rna甲基化最大的特点是非编码rna相关的内容大幅增加,医学相关共计47项!其中主要包括三个研究方向:
1. lncrna或circrna本身的m6a修饰
2. m6a修饰影响mirna的成熟过程(primary mirna的m6a修饰)
3. 非编码rna作为上游因子调控m6a修饰相关的明星分子,从而影响某些mrna的修饰
比如m6a修饰影响mirna的成熟过程,得益于2015年两项重要的奠基性的成果,1篇nature和1篇cell分别证实了m6a修饰能够影响mirna的加工成熟过程以及发现了pri-mirna m6a修饰的reader蛋白hnrnpa2b1。
2019年以来国内学者在非编码rna m6a修饰相关方向也有一些重要成果,如林东昕院士课题组发现吸烟能够通过m6a修饰的途径诱导mir-25-3p的成熟,从而促进胰腺癌的进展,相关成果于2019年4月发表在nature communications上。
如中山大学药学院王红胜课题组发现m6a修饰的lncrna rp11能够通过翻译后上调zeb1蛋白的表达促进结直肠癌的进展,表明lncrna的甲基化可能在结直肠癌中发挥重要作用,相关研究成果发表在2019年4月的molecular cancer上。
总结:近3年来m6a rna甲基化修饰在疾病相关的各个领域都有新的重要的发现,m6a修饰确实参与到多种疾病的发生发展过程,而调控m6a修饰的因素众多,包括多种甲基化修饰酶(writers)、去甲基化修饰酶(erasers)、甲基化修饰识别蛋白(readers)、影响这些酶的上游因子等,同时各种rna都有可能发生m6a修饰。因此rna甲基化方向可以设计多种多样的方案,特别适合于国自然机制研究的胃口。
关于天昊
天昊生物具有多年基因组、转录组和表观组等多组学检测与分析的经验,m6a rna甲基化作为表观领域的一大热点,天昊生物可为您提供m6a整体水平定量,结合rna-seq和m6a merip-seq挖掘潜在的受m6a调控酶影响的靶点,同时可对靶点进行merip-qpcr验证。生信团队亦可提供个性化的数据库挖掘与生信分析内容。
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