为了使大家高效的利用动物基因组数据库信息,更好的挑选感兴趣基因及变异数据用于后续研究,小编整理了一些常用数据库,供大家参考。
1、animal qtldb (猪、牛、羊、马、鸡等qtl信息)
网址:https://www.animalgenome.org/
2、ensembl (比较基因组学、进化、序列变异和转录调控的研究网站)
网址:http://asia.ensembl.org/index.html
3、ucsc genome browser gateway (各类动物基因组信息综合性网站)
网址:https://genome-asia.ucsc.edu/cgi-bin/hggateway?redirect=manual&source=genome.ucsc.edu
4、livestockgenomics数据库 (牛、羊基因组及snp芯片数据)
网址:http://www.livestockgenomics.csiro.au/
5、mammalian annotation database (人、牛、猪、马、兔子、狗、小鼠直系同源基因网站)
网址:https://madb.ethz.ch/
6、mammalian transcriptomic database(mtd)(人、猪、小鼠、大鼠转录组信息)
网址:http://mtd.cbi.ac.cn/
7、lncrnanet(关于猪、人、小鼠lncrna的数据库)
网址:http://lnc.rnanet.org/
8、isheep(关于羊的品种、基因和变异的数据平台)
网址:https://bigd.big.ac.cn/isheep/
9、iscg (国际绵羊基因组学联合会,snp芯片等数据)
网址:https://www.sheephapmap.org/
10、the goat and sheep dna database
网址:https://www.itb.cnr.it/gosh/index.php
11、goat genome数据库(羊snp芯片等数据)
网址:http://www.goatgenome.org/projects.html
12、mouse genome informatics (小鼠基因组数据库)
网址:http://www.informatics.jax.org/
关于天昊
天昊生物可以提供多种动物基因检测及数据分析服务,我们利用自身研发的多项专利技术,包括snpscan®高通量snp分型技术、cnvplex®高通量dna拷贝数检测技术、ssrseqtm超高通量ssr分型技术、methyltarget®多重目的区域甲基化富集测序等技术,为您提供各种通量snp基因分型分析、基因转录水平分析、甲基化水平分析等服务项目。同时还包括动物目的区域富集测序、全转录组测序、动物肠道16s/18s/its扩增子测序、宏基因组测序、线粒体基因组测序等成熟的科研分析服务。
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