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发稿时间:2019-05-27来源:天昊生物


 

tcga肿瘤数据库的挖掘工具不断推陈出新,最近小编又发现一个神器,好用又不失严谨和规范,快和小编一起来了解下吧!

数据库名称:wanderer

数据库网址:

数据库介绍:wanderer是一个以基因为中心的交互式 web 查看器,可用于检索基因在tcga数据库不同肿瘤类型中的dna 甲基化和基因表达情况 (图片可下载,可用于发表)。

参考文章:díez-villanueva, anna, mallona i , peinado m a . wanderer, an interactive viewer to explore dna methylation and gene expression data in human cancer[j]. epigenetics & chromatin, 2015, 8(1):22.

示例:检索pten基因在brca肿瘤中的甲基化和表达情况 (基因区域共65个甲基化探针)

  • 不同位置探针甲基化水平的可视化


 

  • 甲基化和表达量相关性的可视化

 


  •  甲基化和基因表达按统一模式呈现(图片来源于文章)


 

 

 

 

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