新闻媒体-太阳成tyc7111cc

发稿时间：2019-04-18来源：天昊生物

10x研究介绍

单细胞转录组分析（scrna-seq）是一项相当年轻的技术，也是目前最热点的研究方向之一。10x genomics单细胞转录组测序是基于油包水液滴进行单细胞分离，并针对单个细胞内的mrna 进行扩增和高通量测序的一项新技术。单细胞表达谱的绘制能够完美地揭示细胞间基因表达的异质性，从复杂生物样本中发现稀有细胞类型。10x genomics单细胞转录组测序适用于绝大部分细胞类型，并且被广泛应用于肿瘤免疫、肿瘤靶向治疗、肿瘤微环境、非肿瘤相关复杂疾病、发育与细胞分化及植物研究等方向。2019年以来，10x genomics单细胞转录组测序已经发表近百篇文章，10分以上有60%之多。前沿领域，需要的是马上行动起来！看看下面的研究思路是不是能为你带来新的提示呢？

单细胞转录组研究策略

10x技术参数

10x项目流程

10x合作项目部分结果展示

测序数据及细胞质控结果

样本中单细胞基因数、umi序列数及线粒体基因umi序列比例

单个样本细胞聚类tsne图

marker基因cd27 tsne图及小提琴图

10x应用领域

肿瘤细胞异质性

single-cell transcriptomes from human kidneys reveal the cellular identity of renal tumors, 2018, science.（肾细胞癌）

single cell analysis reveals cancer stem cell heterogeneity in hepatocellular carcinoma, 2018, hepatology.（肝细胞癌）

肿瘤药物反应/靶向治疗

single-cell transcriptome analyses reveal endothelial cell heterogeneity in tumors and changes following anti-angiogenic treatment, 2018, cancer research.（抗血管生成）

single-cell rna-seq analysis identifies markers of resistance to targeted braf inhibitors in melanoma cell populations, 2018, genome research.（靶向抑制剂）

肿瘤免疫/免疫治疗

acquired cancer resistance to combination immunotherapy from transcriptional loss of class i hla, 2018, nature communications.（治疗进展；血液 组织）

arg1 expression defines immunosuppressive subsets of tumor-associated macrophages, 2018, theranostics.（anti-pd-1；组织）

非肿瘤相关疾病

single-cell transcriptomics of the mouse kidney reveals potential cellular targets of kidney disease, 2018, science.（肾脏疾病）

single-cell rna-seq reveals the transcriptional landscape and heterogeneity of aortic macrophages in murine atherosclerosis, 2018, circulation research.（动脉粥样硬化）

发育/分化

single-cell rna sequencing of microglia throughout the mouse lifespan and in the injured brain reveals complex cell-state changes, 2019, immunity.（小神经胶质细胞）

single-cell transcriptomic analysis of cardiac differentiation from human pscs reveals hopx-dependent cardiomyocyte maturation, 2018, cell stem cell.（干细胞，心脏分化）

植物领域

single-cell rna sequencing resolves molecular relationships among individual plant cells, 2019, plant physiology.（拟南芥）

spatiotemporal developmental trajectories in the arabidopsis root revealed using high-throughput single-cell rna sequencing, 2019, developmental cell.（拟南芥）