南京农业大学食品科学与技术学院近期在《food & function》上发表了杏鲍菇多糖(pep)对粪便微生物组成和免疫应答影响的文章。在恭喜天昊生物客户发表微生物文章同时,想跟大家分享一下文章的研究思路。
英文题目: in vivo fermentation of a pleurotus eryngii polysaccharide and its effects on fecal microbiota composition and immune response
中文题目:杏鲍菇多糖(pep)对粪便微生物组成和免疫应答影响
期刊名:food & function 影响因子: 3.2469
材料方法:
实验设计
所有老鼠都被关在笼子里,随机分为四组,每组10只小鼠:(1)pep低剂量组(lp):小鼠口服给药每公斤体重0.2克pep;(2)pep中剂量组(mp):小鼠口服给药每公斤体重0.4克pep;(3)pep高剂量组(hp):小鼠口服给药每公斤体重0.8克pep;(4)对照组(蒸馏水)。所有小鼠口服给予pep或蒸馏水在实验周期上午9:00左右灌胃。每只小鼠口服给药量根据每天的体重进行调整。在实验期6周后,收集小鼠粪便,用于粪便dna提取。二乙基乙醚麻醉,颈椎脱臼法处死实验小鼠,在无菌条件下,冷板上纵向解剖获得内容物,每节内容物分成3等份,保存在20−°c用于短链脂肪酸浓度、水分含量、ph值测定。
miseq测序
16s细菌扩增子测序区段为:(v4)。
材料和化学品
新鲜杏鲍菇购买自当地。6种高纯度的scfa(短链脂肪酸)(乙酸、丙酸、i-butyric acids、n-butyric acids、i-valeric acids、n-valeric acids)用于标准溶液的制备。
实验动物
c57bl/6雄性小鼠(6周龄)体重20± 2克,动物适应以下环境两周:温度,25 ± 2 °c;相对湿度,50 ± 5%;12/12小时光暗循环。整个实验过程接受标准饮食。
pep的制备与表征分析
pep制备是根据前期研究进行。pep表征分析,包括纯度检测、均匀性和分子量测定、单糖组成分析、硫酸和糖醛酸含量测定、紫外(uv)光谱和傅里叶变换红外(ft-ir)光谱分析。
研究结果:
pep基本结构
pep的纯度、分子量、单糖组成、硫酸根含量请见表1。在260 nm和280 nm处没有吸收峰,光谱分析表明pep中没有核酸或蛋白质存在(图1a)。pep的ft-ir光谱在500-4000cm−1,3399.9 cm−1位置广阔的伸展峰代表了羟基基团(–oh),揭示了pep多糖链较强的分子内与分子间相互作用(图1b)。
表1 pep的基本特征(纯度、分子量、糖醛酸、硫酸及单糖组成)
图1 pep的紫外(uv)光谱和傅里叶变换红外(ft-ir)光谱
scfa(短链脂肪酸)的测定
对照组和不同剂量pep口服小鼠的scfa总浓度如图2所示:相对于对照组,mp和hp喂养组在盲肠具有显著较高的scfa总浓度。相对于盲肠内容物,结肠内容物具有显著较低的scfa总浓度。随着pep剂量增加,盲肠和结肠内容物中的总scfa浓度分别从13.41 ± 1.78 mmol l −1,5.91 ± 1.23 mmol l−1增加到22.08 ±1.74 mmol l−1 ,7.40 ± 1.65mmol l−1。
图2 对照组和不同剂量pep口服小鼠结肠和盲肠内容物的scfa总浓度
相对于对照组,高剂量pep喂养组(hp)在盲肠具有显著较高的乙酸浓度(图3a),然而结肠在对照组和pep喂养组无显著变化。相对于对照组,高剂量pep喂养组(hp)在盲肠具有显著较高的丙酸浓度(图3b),然而结肠在对照组和pep喂养组无显著变化。相对于对照组,高剂量pep喂养组(hp)在盲肠具有显著较高的两种丁酸浓度(图3c,d)。相对于对照组,高剂量pep喂养组(hp)在盲肠和结肠都具有显著较高的i-valeric浓度(图3e)。而n-valeric在对照组和pep喂养组的盲肠无显著变化(图3f)。
图3对照组和不同剂量pep口服小鼠结肠和盲肠内容物的乙酸(a)、丙酸(b)、i-butyric acids (c)、n-butyric acids (d)、i-valeric acids (e)、n-valeric acids (f)。
结肠和盲肠内容物ph值和含水量
口服pep后,结肠和盲肠内容物的ph值随着pep剂量增加而降低(图4a),这可能是由于胃肠道微生物的pep发酵产物所致。口服pep后,结肠和盲肠内容物的含水量随着pep剂量增加而升高(图4b),这可以归因于整个实验期间胃肠道内容物pep强大的持水能力。
图4 对照组和不同剂量pep口服小鼠结肠和盲肠内容物的ph值(a)和含水量(b)。
粪便微生物组成
口服pep 会导致粪便丰富度增加。厚壁菌、拟杆菌、变形杆菌是主要的门,相对于对照组,高剂量pep喂养组厚壁菌门的相对丰度明显减少,而拟杆菌门明显增加(图5a);纲水平,高剂量pep喂养组bacterioidia 和bacilli的相对丰度增加, clostridia的相对丰度减少(图5b);目水平,高剂量pep喂养组bacteroidales和lactobacillales的相对丰度显著增加,clostridiales的相对丰度减少(图5c);科水平,高剂量pep喂养组porphyromonadaceae,rikenellaceae,bacteroidaceae,lactobacillaceae的相对丰度显著增加,lachnospiraceae and ruminococcaceae的相对丰度减少(图5d);
图5对照组和不同剂量pep口服小鼠粪便菌群在门(a)、纲(b)、目(c)、科(d)水平上的分类。0–1到0–10, 1–1到1–10, 2–1到2–10,3–1到3–10粪便代表对照组,lp组,mp 组,hp组。
小鼠粪便菌群热图表明低剂量pep喂养组和对照组的粪便菌群比较类似,中剂量pep喂养组和高低剂量pep喂养组的粪便菌群比较接近(图6)。
图6 对照组和不同剂量pep口服小鼠粪便菌群热图分析。0–1到0–10, 1–1到1–10, 2–1到2–10,3–1到3–10粪便代表对照组,lp组,mp 组,hp组。
pcoa分析显示各组间微生物群落具有差异性(图7)。
图7对照组和不同剂量pep口服小鼠粪便菌群pcoa分析。
免疫应答分析
在全程灌胃期间,不同组别每星期小鼠体重变化没有差异,说明不同处理组小鼠的健康状况相同。脾脏、肝脏和胸腺指数如下表2所示。相对于对照组,高剂量pep喂养组胸腺指数具有非常显著性差异(p<0.01),脾脏、肝脏指数则有显著性差异(p<0.05)。
表2 pep处理对脏器指数的影响
各组血清及肠内容物中的免疫细胞因子分泌情况如图8所示。pep处理后血清il-12浓度无显著变化。然而,相对于对照组,高剂量pep喂养组的血清tnf-α,ifn-γ,il-1,il-2, il-6和盲肠和结肠slga显著增加,提示了pep的免疫功能调节作用。
图8 pep对血清免疫细胞因子(a, tnf-α; b, ifn-γ; c, il-1; d, il-2; e, il-6; f, il-12)和盲肠(h)和结肠(i)slga的影响,n=10。
总结:
关于天昊:
天昊生物采用miseq pe250测序策略对细菌16s rdna区/真菌its区/真菌18s rdna区的双v区或多种单v区进行测序,使用低循环数扩增,保证每个样品扩增的循环数统一;采用特殊方法可有效避免系统内误差;数据质量高,有效序列q30达到90%以上;加上最新升级的分析内容和解释详尽的结题报告,带您享受极致的微生物扩增子测序体验。